futbol federasyonu 1966 yılında cumhurbaşkanlığı kupasını başlatmıştır. cumhurbaşkanlığı kupası türkiye birinci ligi'nde birinci olan takımla, federasyon kupası birincisi arasında oynanmaktadır. türkiye profesyonel birinci lig şampiyonu aynı zamanda federasyon kupası'nı da kazandığı taktirde, cumhurbaşkanlığı kupası'nı birinci lig ikincisi ile oynamaktadır. kupa 1981 ve 1982 yıllarında "devlet başkanlığı" adı altında oynanmıştır. 1997-1998 sezonunda son kez düzenlenen kupanın bir benzeri 2005-2006 sezonunda tff süpr kupa adı altında ve finalleri türkiye dışında bir ülkede oynanarak tekrar düzenlenmeye başlanmıştır.
ilk cumhurbaşkanlığı kupasını o sezonun türkiye kupası şampiyonu olan galatasaray, lig şampiyonu beşiktaşı 2-0 yenerek müzesine götürmüştür.
ilginç bir not olarak o sezon türkiye kupasını kazanan galatasaray finalde de yine beşiktaş ile karşılaşmış ve 1-0 kazanarak türkiye kupasını kazanmıştır.
halit kıvanç'ın 1983 basımlı "gool diye diye" kitabından;
bu maçta türkiye kupası galibi galatasaray'la türkiye ligi şampiyonu beşiktaş karşı karşıya gelmiş, sarı-kırmızılı takım turan ve ayhan'ın golleriyle maçı 2-0 kazanmış kupayı almıştı. bu maçın özelliği de, beşiktaş'ın geri dörtlüsünde bir yugoslav futbolcunun, kaliçanin'in yer almasıydı. yani yugoslav futbolcu akınını başlangıcı sayılırdı bu final.
yine bu maçtan sonra bir yenilik spor basınımızda yer almış, gazetelerimizin spor sayfalarında futbol takımlarının dizilişi "kaleci-2 bek-3 haf-5 forvet" şeklinde değil, ingiltere'deki son dünya kupasından uygulanan şekille, "4-3-3" biçiminde yazılmıştı.
bu ilk cumhurbaşkanlığı kupası'nda kupayı cumhurbaşkanı cevdet sunay'ın sahaya inerek galatasaray kaptanı metin oktay'a vermesi, hayli eleştiri kaynağı olmuş, "bu tür törenlerde kupayı kazanan takımın şeref tribününe çıkması gerektiği" belirtilmişti. "ilk" olmaktan doğan bu organizasyon hatası, sonraki yıllarda tekrarlanmayacaktı.
1966 cumhurbaşkanlığı kupası, 1. lig'in 1965-66 sezonunu şampiyonlukla tamamlayan beşiktaş ile 1965-66 sezonu türkiye kupası şampiyonu galatasaray arasında oynanan ilk cumhurbaşkanlığı kupası maçıdır. 21 eylül 1966'da, ankara 19 mayıs stadyumu'nda oynanan maçı galatasaray, turan doğangün ve ayhan elmastaşoğlu'nun golleriyle kazanarak ilk kez düzenlenen organizasyonu şampiyon olarak tamamladı.