1986-1987 sezonu balkan kupası 8 takımın katılımıyla düzenlendi. 8 takım çift ayaklı çeyrek final maçları yaptılar. türkiye'yi temsilen kupaya katılacak olan trabzonspor kupadan çekildi ve bulgar slavia sofya otomatikman yarı finale yükseldi.
işin ilginç yanı, slavya sofya yarı finalde yunan iraklis ile karşı karşıya gelecekti ama o da kupadan çekilince slavia sofya otomatikman finale yükseldi.