veda etti eskişehirspor, 12 yıl aranın ardından 2008-2009 sezonunda yeniden mücadele etmeye başladığı spor toto süper lig'e 7 sezon sonra veda etti.
kurulduğu yıl olan 1965-1966 sezonunda ikinci ligde mücadele eden eskişehirspor, bir yıl sonra 1. lig'e yükseldi. siyah-kırmızılı takım burada aralıksız 15 sezon mücadele ettiği ligin en tecrübeli takımları arasında yer aldı.
ilk kez 1981-1982 sezonunda alt lige düştü eskişehirspor, 1981-1982 sezonunda 16 yıl sonra 29 puanla ligi 15. sırada bitirip 2. lig'e düştü. 2. lig'de 1983-1984 sezonunda 43 puan toplayan eskişehir temsilcisi, süper lig'e çıkamadı.
siyah-kırmızılılar, bir sonraki sezon 16 takım arasından şampiyonluğa ulaşarak, süper lig'e yeniden yükseldi. 1984-1985, 1985-1986, 1986-1987 ve 1987-1988 sezonlarında da yeniden süper lig'de boy gösteren siyah-kırmızılı takım, 1987-1988 sezonunu 46 puanla 15. puanla bitirince küme düştü.
3. lig'e düştü eskişehir temsilcisi, 1988-1989, 1989-1990, 1990-1991 ve 1991-1992 sezonlarında 2. lig'de bir üst kümeye çıkmak için mücadele gösterdi. 1991-1992 sezonunu 40 puan toplayan eskişehirspor, tarihinde ilk kez 3. lig'e düştü.
eskişehirspor'un 3. lig macerası fazla uzun sürmedi. bir sonraki sezon 73 puanla şampiyonluğu kazanıp türkiye 2. ligi'ne dönen eskişehirspor, 1993-1994 ve 1994-1995 sezonunu bu ligde geçirdi.
siyah-kırmızılı takım, 1994-1995 sezonunda konya'da yapılan süper lig'e yükselme grubu maçlarında 7 takımı geride bırakarak 2. lig'den ayrıldı.
12 sezon aradan sonra süper lig'e "merbaha" eskişehirspor, 1995-1996 sezonunda bir kez daha süper lig'e döndü ancak başarısız sonuçlar nedeniyle yeniden bir alt lige düştü.
eskişehir temsilcisi, 1996-1997, 1997-1998, 1998-1999, 1999-2000, 2000-2001 sezonlarında 2. lig'de mücadele ederken son sezon bir alt lige düştü.
2001-2002, 2002-2003, 2003-2004, 2004-2005, 2005-2006, 2006-2007 ve 2007-2008 sezonlarından bir alt ligde mücadele gösteren siyah-kırmızılı takım, 2008-2009 sezonunda süper lig'de boy göstermeye hak kazandı.
süper lig'i 2008-2009 sezonundan beri çeşitli sıralamalarda bitiren eskişehirspor, 30 puan topladığı bu sezon ligi 17. sırada bitirince ptt 1. lig'e düştü.
